高中二年級的春天，雨宮蓮轉學至東京的“秀盡學園”。以某個事件為契機覺醒為“PERSONA”使者的蓮，與新認識的夥伴們一同組成“心之怪盜團”。把沾滿邪惡欲望的大人們的“扭曲欲望”給偷走，讓其改過自新。另一方面，在城市中陸續發生了不可思議的精神....