英國上校珀西哈里森佛斯特（查理漢納 飾）和副官亨利科斯丁（羅伯派汀森 飾）深入神秘的南美洲亞馬遜叢林探險，竟發現當地曾出現世界未知的文明生活跡象，他回到英國公開這個意義深遠的重大發現，卻被當成笑話嘲弄，沒有人願意相信他的話。在愛妻（席安娜米勒 飾）無怨無悔支持下，佛斯特決心帶領兒子傑克（湯姆荷蘭 飾）重返亞馬遜叢林，尋找古文明存在的證據，一行人卻離奇消失，從此再無任何音訊，成為史上最神秘又懸疑的失蹤事件。